DebiChem Project
Summary
2d structure editors
DebiChem 2D structure editors

This metapackage will install 2D structure editors which might be useful for chemists.

The list to the right includes various software projects which are of some interest to the DebiChem Project. Currently, only a few of them are available as Debian packages. It is our goal, however, to include all software in DebiChem which can sensibly add to a high quality Debian Pure Blend.

For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:

If you discover a project which looks like a good candidate for DebiChem to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to send a description of that project to the DebiChem mailing list

Links to other tasks

DebiChem 2d structure editors packages

Official Debian packages with high relevance

Bkchem
Редактор хімічних структур
Versions of package bkchem
ReleaseVersionArchitectures
squeeze0.13.0-2all
wheezy0.13.0-4all
sid0.13.0-4all
Debtags of package bkchem:
fieldchemistry
roleprogram
Popcon: 45 users (31 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

BKchem — це безкоштовна хімічна креслярська програма, яка написана на Пітоні.

Деякі з можливостей, які б Ви могли очікувати:

  • Малювання (примітиви зв’язок-зв’язок; шаблони для загальних кілець, розширення звичайних груп; відображення радикалів, зарядів, стрілок; підтримка кольору …)

  • Редагування (можливість необмеженої кількості відміни та повтору; вирівнювання; масштабування; обертання (2D, 3D) …)

  • Експорт/імпорт (повністю підтримує експорт в SVG, OpenOffice.org-Draw, та EPS; базова підтримка імпорті/експорту для CML1 та CML2)

Screenshots of package bkchem
Chemtool
Програма для малювання хімічних сполук
Versions of package chemtool
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.6.12-1amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy1.6.13-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid1.6.13-1amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package chemtool:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
scopeapplication
uitoolkitgtk
uselearning, editing
works-withimage:vector, image
works-with-formatsvg
x11application
Popcon: 68 users (205 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

Chemtool — 2D-редактор для малювання хімічних сполук у X11 (використовується GTK+). Він підтримує багато стилів з’єднання, більшу частину видів показу тексту, що використовуються в хімії та сплайнові/дугові/криволінійні стрілки.

Малюнки можна експортувати у формати MOL і PDB, для подальшого опису — в SVG або XFig, у вигляді малюнків PiCTeX, в растрові або Postscript файли (для деяких операцій використовується програма з XFig — transfig).

Також пакунок містить допоміжну програму, cht, для обчислення формул і (точно) молекулярної ваги намальованого елемента з файлу chemtool. Cht може викликатися прямо з Chemtool або з консолі.

Please cite: Matthias Brüstle: Chemtool - Moleküle zeichnen mit dem Pinguin. (eprint) Nachr. Chem. 49(11):1310-1313 (2001)
Screenshots of package chemtool
Easychem
Показ високо-якісних молекул та двовимірних хімічних формул
Maintainer: Debichem Team
Versions of package easychem
ReleaseVersionArchitectures
squeeze0.6-6amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy0.6-7amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid0.6-8amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package easychem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitgtk
useviewing, learning, editing
x11application
Popcon: 44 users (67 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

EasyChem — програма що допомагає вам створювати високо-якісні діаграми молекул та двовимірних хімічних формул, які можуть бути експортовані у формати PDF, PS, LaTeX та FIG.

EasyChem спочатку розроблявся для створення діаграм для книг з хімії і тепер він часто використовується для цього в комерційних та не-комерційних виданнях, пов’язаних з хімією.

Screenshots of package easychem
Gchempaint
Редактор двовимірних хімічних структур для оточення GNOME2
Maintainer: Debichem Team
Versions of package gchempaint
ReleaseVersionArchitectures
squeeze0.12.4-1amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy0.12.12-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid0.12.12-1armel,armhf,mips,mipsel
sid0.14.2-1amd64,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package gchempaint:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
suitegnome
uitoolkitgtk
uselearning, editing
x11application
Popcon: 51 users (92 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free
Svn

GChemPaint — редактор для двовимірних хімічних структур із багатовіконним інтерфейсом. За намальованими молекулами можна шукати у NIST Webbook та PubChem.

Screenshots of package gchempaint
Xdrawchem
Редактор хімічних структур та реакцій
Maintainer: Georges Khaznadar ()
Versions of package xdrawchem
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.9.9-4.1amd64,armel,i386,ia64,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy2.0-2amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid2.0-2amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package xdrawchem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitqt
useviewing, learning, editing
x11application
Popcon: 45 users (64 upd.)*
Versions and Archs
License: DFSG free

Xdrawchem — двовимірний редактор для хімічних структур та реакцій. Він повторює можливості комерційного набору „ChemDraw“ та має файли сумісні з ним, як із іншими хімічними форматами через „OpenBabel“.

Screenshots of package xdrawchem

Packaging has started and developers might try the packaging code in VCS

Osra - wnpp
optical structure recognition application
License: free
Debian package not available
Svn
Version: 1.3.9-1

OSRA (Optical Structure Recognition Application) is a utility designed to convert graphical representations of chemical structures, as they appear in journal articles, patent documents, textbooks, trade magazines etc., into SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry Specification) or SD files - computer recognizable molecular structure formats. OSRA can read a document in any of the over 90 graphical formats parseable by ImageMagick - including GIF, JPEG, PNG, TIFF, PDF, PS etc., and generate the SMILES or SDF representation of the molecular structure images encountered within that document.

Remark of DebiChem team: Packaging was discussed at
*Popularitycontest results: number of people who use this package regularly (number of people who upgraded this package recently) out of 165117