Summary
2d structure editors
DebiChem 2D structure editors
This metapackage will install 2D structure editors which might be
useful for chemists.
The list to the right includes various software projects which are of some interest to the DebiChem Project. Currently, only a few of them are available as Debian packages. It is our goal, however, to include all software in DebiChem which can sensibly add to a high quality Debian Pure Blend.
For a better overview of the project's availability as a Debian package, each head row has a color code according to this scheme:
If you discover a project which looks like a good candidate for DebiChem
to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to
send a description of that project to the DebiChem mailing list
Links to other tasks
|
DebiChem 2d structure editors packages
Official Debian packages with high relevance
|
Bkchem
Редактор хімічних структур
|
| Versions of package bkchem |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 0.13.0-2 | all |
| wheezy | 0.13.0-4 | all |
| sid | 0.13.0-4 | all |
| Debtags of package bkchem: |
| field | chemistry |
| role | program |
|
License: DFSG free
|
|
BKchem — це безкоштовна хімічна креслярська програма, яка написана на Пітоні.
Деякі з можливостей, які б Ви могли очікувати:
-
Малювання (примітиви зв’язок-зв’язок; шаблони для загальних кілець,
розширення звичайних груп; відображення радикалів, зарядів, стрілок;
підтримка кольору …)
-
Редагування (можливість необмеженої кількості відміни та повтору;
вирівнювання; масштабування; обертання (2D, 3D) …)
-
Експорт/імпорт (повністю підтримує експорт в SVG, OpenOffice.org-Draw,
та EPS; базова підтримка імпорті/експорту для CML1 та CML2)
|
|
|
Chemtool
Програма для малювання хімічних сполук
|
| Versions of package chemtool |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 1.6.12-1 | amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 1.6.13-1 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 1.6.13-1 | amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package chemtool: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| scope | application |
| uitoolkit | gtk |
| use | learning, editing |
| works-with | image:vector, image |
| works-with-format | svg |
| x11 | application |
|
License: DFSG free
|
|
Chemtool — 2D-редактор для малювання хімічних сполук у X11
(використовується GTK+). Він підтримує багато стилів з’єднання, більшу
частину видів показу тексту, що використовуються в хімії та
сплайнові/дугові/криволінійні стрілки.
Малюнки можна експортувати у формати MOL і PDB, для подальшого опису — в
SVG або XFig, у вигляді малюнків PiCTeX, в растрові або Postscript файли
(для деяких операцій використовується програма з XFig — transfig).
Також пакунок містить допоміжну програму, cht, для обчислення формул і
(точно) молекулярної ваги намальованого елемента з файлу chemtool. Cht може
викликатися прямо з Chemtool або з консолі.
|
|
|
Easychem
Показ високо-якісних молекул та двовимірних хімічних формул
|
| Versions of package easychem |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 0.6-6 | amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 0.6-7 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 0.6-8 | amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package easychem: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| uitoolkit | gtk |
| use | viewing, learning, editing |
| x11 | application |
|
License: DFSG free
|
|
EasyChem — програма що допомагає вам створювати високо-якісні діаграми
молекул та двовимірних хімічних формул, які можуть бути експортовані у
формати PDF, PS, LaTeX та FIG.
EasyChem спочатку розроблявся для створення діаграм для книг з хімії і
тепер він часто використовується для цього в комерційних та не-комерційних
виданнях, пов’язаних з хімією.
|
|
|
Gchempaint
Редактор двовимірних хімічних структур для оточення GNOME2
|
| Versions of package gchempaint |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 0.12.4-1 | amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 0.12.12-1 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 0.12.12-1 | armel,armhf,mips,mipsel |
| sid | 0.14.2-1 | amd64,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package gchempaint: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| suite | gnome |
| uitoolkit | gtk |
| use | learning, editing |
| x11 | application |
|
License: DFSG free
|
|
GChemPaint — редактор для двовимірних хімічних структур із багатовіконним
інтерфейсом. За намальованими молекулами можна шукати у NIST Webbook
та PubChem.
|
|
|
Xdrawchem
Редактор хімічних структур та реакцій
|
| Versions of package xdrawchem |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 1.9.9-4.1 | amd64,armel,i386,ia64,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 2.0-2 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 2.0-2 | amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package xdrawchem: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| uitoolkit | qt |
| use | viewing, learning, editing |
| x11 | application |
|
License: DFSG free
|
|
Xdrawchem — двовимірний редактор для хімічних структур та реакцій. Він
повторює можливості комерційного набору „ChemDraw“ та має файли сумісні з
ним, як із іншими хімічними форматами через „OpenBabel“.
|
|
Packaging has started and developers might try the packaging code in VCS
optical structure recognition application
|
License: free
Debian package not available
Version: 1.3.9-1
|
|
OSRA (Optical Structure Recognition Application) is a utility
designed to convert graphical representations of chemical structures,
as they appear in journal articles, patent documents, textbooks,
trade magazines etc., into SMILES (Simplified Molecular Input Line
Entry Specification) or SD files - computer recognizable molecular
structure formats. OSRA can read a document in any of the over
90 graphical formats parseable by ImageMagick - including GIF, JPEG,
PNG, TIFF, PDF, PS etc., and generate the SMILES or SDF representation
of the molecular structure images encountered within that document.
|
|