Summary
2d structure editors
DebiChem 2D structure editors
This metapackage will install 2D structure editors which might be
useful for chemists.
The list to the right includes various software projects which are of some interest to the DebiChem Project. Currently, only a few of them are available as Debian packages. It is our goal, however, to include all software in DebiChem which can sensibly add to a high quality Debian Pure Blend.
Per una migliore visione d'insieme della disponibilità del progetto come pacchetto Debian, ogni riga ha un colore codificato secondo il seguente schema:
If you discover a project which looks like a good candidate for DebiChem
to you, or if you have prepared an unofficial Debian package, please do not hesitate to
send a description of that project to the DebiChem mailing list
Links to other tasks
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DebiChem 2d structure editors packages
Official Debian packages with high relevance
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Bkchem
editor di strutture chimiche
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| Versions of package bkchem |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 0.13.0-2 | all |
| wheezy | 0.13.0-4 | all |
| jessie | 0.13.0-4 | all |
| sid | 0.13.0-4 | all |
| Debtags of package bkchem: |
| field | chemistry |
| role | program |
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License: DFSG free
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BKchem è un programma libero di disegno chimico, che è scritto in Python.
Alcune delle sue funzionalità:
- disegno (disegno legame-per-legame; modelli per anelli comuni;
espansione di gruppi comuni; disegno di radicali, cariche, frecce;
supporto per colori...);
- modifica (capacità illimitate per operazioni annulla/ripeti;
allineamento; ridimensionamento; rotazione (2D, 3D)...);
- esportazione/importazione (esportazione in SVG, OpenOffice.org-Draw,
EPS pienamente supportata; supporto di base per importazione ed
esportazione CML1 e CML2).
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Chemtool
programma per il disegno di strutture chimiche
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| Versions of package chemtool |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 1.6.12-1 | amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 1.6.13-1 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| jessie | 1.6.13-1 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 1.6.13-1 | amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package chemtool: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| scope | application |
| uitoolkit | gtk |
| use | learning, editing |
| works-with | image:vector, image |
| works-with-format | svg |
| x11 | application |
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License: DFSG free
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Chemtool è un editor 2D per X11 per strutture chimiche basato su GTK+.
Supporta molti stili per i legami, la maggior parte dei tipi di testo
necessari per impaginare testi chimici e spline/archi/frecce curve.
I disegni possono essere esportati in formato MOL e PDB, in formato SVG
* XFig per ulteriori annotazioni, come disegni PiCTex, come bitmap o
file PostScript (molti di questi grazie a transfig, il programma compagno
di Xfig).
Il pacchetto contiene anche un programma di aiuto, cht, per calcolare
le formule somma e il peso molecolare (esatto) a partire da un file di
disegno di chemtool. Cht può essere invocato direttamente da Chemtool o
dalla console.
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Easychem
disegno di molecole e formule chimiche 2D di alta qualità
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| Versions of package easychem |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 0.6-6 | amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 0.6-7 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| jessie | 0.6-8 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 0.6-8 | amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package easychem: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| uitoolkit | gtk |
| use | viewing, learning, editing |
| x11 | application |
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License: DFSG free
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EasyChem è un programma che aiuta a creare diagrammi di alta qualità di
molecole e di formule chimiche 2D, i quali possono essere esportati come
PDF, PS, LaTeX e fig.
EasyChem è stato originariamente sviluppato per creare diagrammi per libri
di chimica ed è ora usato di frequente a questo scopo in libri relativi
alla chimica commerciali e non commerciali.
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Gchempaint
editor di strutture chimiche 2D per il desktop GNOME2
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| Versions of package gchempaint |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 0.12.4-1 | amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 0.12.12-1 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| jessie | 0.12.12-1 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 0.14.2-1 | amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package gchempaint: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| suite | gnome |
| uitoolkit | gtk |
| use | learning, editing |
| x11 | application |
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License: DFSG free
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GChemPaint è un editor per strutture chimiche 2D con interfaccia a
documenti multipli. Le molecole disegnate possono essere ricercate nel NIST
Webbook e tramite PubChem.
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Xdrawchem
editor per strutture e reazioni chimiche
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| Versions of package xdrawchem |
| Release | Version | Architectures |
| squeeze | 1.9.9-4.1 | amd64,armel,i386,ia64,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc |
| wheezy | 2.0-2 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| jessie | 2.0-2 | amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| sid | 2.0-2 | amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc |
| Debtags of package xdrawchem: |
| field | chemistry |
| interface | x11 |
| role | program |
| uitoolkit | qt |
| use | viewing, learning, editing |
| x11 | application |
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License: DFSG free
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Xdrawchem è un editor 2D per strutture e reazioni chimiche. Ha funzionalità
corrispondenti a quelle della suite commerciale ChemDraw, ha inoltre la
compatibilità dei file con essa, così come con altri formati relativi alla
chimica grazie a OpenBabel.
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Packaging has started and developers might try the packaging code in VCS
optical structure recognition application
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License: free
pacchetto Debian non disponibile
Version: 1.4.0-1
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OSRA (Optical Structure Recognition Application) is a utility
designed to convert graphical representations of chemical structures,
as they appear in journal articles, patent documents, textbooks,
trade magazines etc., into SMILES (Simplified Molecular Input Line
Entry Specification) or SD files - computer recognizable molecular
structure formats. OSRA can read a document in any of the over
90 graphical formats parseable by ImageMagick - including GIF, JPEG,
PNG, TIFF, PDF, PS etc., and generate the SMILES or SDF representation
of the molecular structure images encountered within that document.
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