DebiChem Project
Zusammenfassung
2d structure editors
DebiChem 2D structure editors

This metapackage will install 2D structure editors which might be useful for chemists.

Die Liste auf der rechten Seite enthält verschiedene Softwareprojekte, die für das DebiChem Projekt von Interesse sind. Derzeit sind nur einige von diesen als Debianpakete verfügbar. Zielsetzung ist es jedoch, all die Software für DebiChem zu paketieren, um einen qualitativ hochwertiges Debian Pure Blend (interne Anpassung von Debian an spezielle Bedürfnisse) zu erstellen.

Um einen besseren Überblick über die Verfügbarkeit der Projekte als Debian Paket zu geben, hat jede Kopfzeile einen Farbcode entsprechend diesem Schema:

Wenn Sie ein Projekt entdecken, das ein guter Kandidat für DebiChem zu sein scheint, oder wenn Sie ein inoffizielles Debianpaket erstellt haben, zögern Sie bitte nicht eine Beschreibung des Projekts an die DebiChem Mailingliste zu schicken.

Links zu Aufgaben

DebiChem 2d structure editors packages

Offizielle Debianpakete mit hoher Relevanz

Bkchem
Editor für chemische Strukturen
Betreuer: Debichem Team
Versions of package bkchem
ReleaseVersionArchitectures
squeeze0.13.0-2all
wheezy0.13.0-4all
jessie0.13.0-4all
sid0.13.0-4all
Debtags of package bkchem:
fieldchemistry
roleprogram
Popcon: 42 users (28 upd.)*
Versions and Archs
Lizenz: DFSG free
Svn

BKchem ist ein freies Chemie-Zeichenprogramm, das in Python geschrieben ist.

Einige Eigenschaften, die Sie erwarten können:

  • Zeichnen (Zeichnen von Bindung zu Bindung; Vorlagen für gebräuchliche Ringstrukturen; Expansion gebräuchlicher Gruppen; Zeichnen von Radikalen, Ladungen, Pfeilen; Unterstützung von Farben ...)
  • Bearbeiten (unbegrenztes Rückgängig machen und Wiederherstellen; Ausrichten; Skalieren; Rotation (2D, 3D) ...)
  • Export/Import (vollständige Unterstützung von SVG-, OpenOffice.org-Draw-, EPS-Export; grundlegende Unterstützung von CML1- und CML2-Im- und Export)
Screenshots of package bkchem
Chemtool
Zeichenprogramm für chemische Strukturen
Betreuer: Debichem Team
Versions of package chemtool
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.6.12-1amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy1.6.13-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie1.6.13-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid1.6.13-1amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package chemtool:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
scopeapplication
uitoolkitgtk
uselearning, editing
works-withimage:vector, image
works-with-formatsvg
x11application
Popcon: 56 users (56 upd.)*
Versions and Archs
Lizenz: DFSG free
Svn

Chemtool ist ein zweidimensionaler GTK+-basierter Editor für chemische Strukturen für X11. Er unterstützt viele Bindungstypen, die meisten Formen von Text, der für chemischen Schriftsatz benötigt wird, und Splines, Bögen und gekrümmte Pfeile.

Zeichnungen können in das MOL-, PDB-, SVG- und XFig-Format zur weiteren Kommentierung, so wie in eine PiCTeX-Zeichnung, als Bitmap oder als PostScript-Dateien (die meisten dieser durch das XFig-Begleitprogramm transfig) exportiert werden.

Das Paket beinhaltet auch das Hilfsprogramm »cht«, um Summenformeln und ein (exaktes) Molekulargewicht aus einer Chemtool-Zeichnung berechnen zu können. »cht« kann entweder von Chemtool direkt oder von der Konsole aufgerufen werden.

Please cite: Matthias Brüstle: Chemtool - Moleküle zeichnen mit dem Pinguin. (eprint) Nachr. Chem. 49(11):1310-1313 (2001)
Screenshots of package chemtool
Easychem
Zeichnet hochqualitative Molekül- und zweidimensionale chemische Formeln
Betreuer: Debichem Team
Versions of package easychem
ReleaseVersionArchitectures
squeeze0.6-6amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy0.6-7amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie0.6-8amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid0.6-8amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package easychem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitgtk
useviewing, learning, editing
x11application
Popcon: 37 users (78 upd.)*
Versions and Archs
Lizenz: DFSG free
Svn

EasyChem ist ein Programm, welches Ihnen hilft, hochqualitative Diagramme von Molekülen und zweidimensionale chemische Formeln zu erstellen, welche nach PDF, PS, LaTeX und fig exportiert werden können.

EasyChem wurde ursprünglich entwickelt, um Diagramme für Chemiebücher zu erstellen, und wird mittlerweile für kommerzielle und nichtkommerzielle Chemiebücher eingesetzt.

Screenshots of package easychem
Gchempaint
Editor für chemische 2D-Strukturen für die GNOME2-Arbeitsfläche
Betreuer: Debichem Team
Versions of package gchempaint
ReleaseVersionArchitectures
squeeze0.12.4-1amd64,armel,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy0.12.12-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie0.12.12-1amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid0.14.2-1amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package gchempaint:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
suitegnome
uitoolkitgtk
uselearning, editing
x11application
Popcon: 44 users (40 upd.)*
Versions and Archs
Lizenz: DFSG free
Svn

GChemPaint ist ein Editor für chemische 2D-Strukturen mit einer Schnittstelle für mehrere Dokumente. Gezeichnete Moleküle können im NIST Webbook und in PubChem gesucht werden.

Screenshots of package gchempaint
Xdrawchem
Editor für chemische Strukturen und Reaktionen
Versions of package xdrawchem
ReleaseVersionArchitectures
squeeze1.9.9-4.1amd64,armel,i386,ia64,mips,mipsel,powerpc,s390,sparc
wheezy2.0-2amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
jessie2.0-2amd64,armel,armhf,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
sid2.0-2amd64,armel,armhf,hurd-i386,i386,ia64,kfreebsd-amd64,kfreebsd-i386,mips,mipsel,powerpc,s390,s390x,sparc
Debtags of package xdrawchem:
fieldchemistry
interfacex11
roleprogram
uitoolkitqt
useviewing, learning, editing
x11application
Popcon: 35 users (41 upd.)*
Versions and Archs
Lizenz: DFSG free

Xdrawchem ist ein zweidimensionaler Editor für chemische Strukturen und Reaktionen. Er spiegelt die Fähigkeiten der kommerziellen ChemDraw-Suite und ist durch Openbabel zu derem und anderen Formaten kompatibel.

Screenshots of package xdrawchem

Paketierung hat begonnen und Entwickler könnten einen Versuch mit dem Code im VCS starten

Osra - wnpp
optical structure recognition application
Verantwortlich: Debichem Team (Daniel Leidert)
Lizenz: free
Debianpaket nicht verfügbar
Svn
Version: 1.4.0-1

OSRA (Optical Structure Recognition Application) is a utility designed to convert graphical representations of chemical structures, as they appear in journal articles, patent documents, textbooks, trade magazines etc., into SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry Specification) or SD files - computer recognizable molecular structure formats. OSRA can read a document in any of the over 90 graphical formats parseable by ImageMagick - including GIF, JPEG, PNG, TIFF, PDF, PS etc., and generate the SMILES or SDF representation of the molecular structure images encountered within that document.

Remark of DebiChem team: Packaging was discussed at
*Pupularitätswetbewerbsergebnisse: Anzahl der Nutzer, die das Paket regelmäßig nutzen (Anzahl der Nutzer, die das Paket kürzlich aktualisiert haben) von insgesamt 151825